Зелени водоник има широк спектар примена у различитим индустријама, што покреће напоре за декарбонизацију на глобалном нивоу. У транспортном сектору, то покреће возила са горивним ћелијама (ФЦВ), укључујући путничке аутомобиле, камионе и дронове, који емитују само водену пару и елиминишу емисије из издувних цеви. Индустријске примене су једнако значајне: служи као чиста алтернатива фосилним горивима у производњи челика (замењује кокс), смањујући емисије угљеника из једне од најенергетски интензивнијих индустрија. У хемијској производњи, зелени водоник се користи у производњи амонијака, кључне компоненте у ђубрива, и у рафинирању процеса да се смањи зависност од фосилног водоника. За стамбену и комерцијалну употребу, може се интегрисати у домаће енергетске системе, где се вишак соларне енергије претвара у водород путем електролизе, складишти и касније користи за електричну енергију или за грејање путем горивних ћелија. Поред тога, зелени водоник може да генерише електричну енергију у стационарним електроцентралама са горивним ћелијама, подржавајући стабилност мреже и пружајући резервну енергију, што додатно ојачава његову улогу као решења за чисту енергију са вишенаменским сврхом.